孙晓建/周小龙/陈赛娟团队合作解析AAR和UPR通路在应激性血管生成中的选择性和竞争性功能
作者:luojiao 发布时间:2021/12/31 10:00:00
生命体的一个重要特征是能够感受各种刺激(stress)并产生应激反应(stress response)。其中一个典型的例子是被称为整合应激反应(integrated stress response, ISR)的一系列应激信号通路。在高等生物中,ISR包括:(1)GCN2介导应对氨基酸缺乏的氨基酸反应(amino acid response, AAR);(2)PERK介导应对蛋白错误折叠的未折叠蛋白反应(unfolded protein response, UPR);(3)PKR介导应对病毒感染的应激反应;(4)HRI介导应对红细胞铁缺乏的应激反应(图1)。虽然这些刺激的类型完全不同,但这4个激酶均可在被激活后磷酸化同一个效应分子的同一位点——即蛋白翻译调控因子eIF2α的第51位丝氨酸(图1)。
图1 ISR通路内的四个关键激酶磷酸化eIF2α同一位点—Ser51。
ISR对于正常胚胎发育至关重要,其异常也与多种疾病的发生发展密切相关,如生长迟缓、神经退行性疾病、免疫系统紊乱、糖尿病以及癌症等(图2)。由于ISR所引起的下游分子事件看起来完全相同,人们很难厘清这些密切偶联的不同应激信号通路在其功能上的差异。而且目前也缺乏明确的证据证明生物体能够真正区分其eIF2α磷酸化是由哪个激酶催化的,并由此对不同的刺激类型产生不同的反应。同时,究竟哪个上游激酶的特异激活,导致哪些特定疾病的发生,目前仍不清楚。
图2 ISR在胚胎发育、疾病发生过程中具有重要作用。
2021年10月26日,上海交通大学医学院附属瑞金医院孙晓建课题组与中科院分子细胞卓越中心(生化与细胞所)周小龙课题组以及瑞金医院陈赛娟课题组合作,在Cell Discovery发表题为“Selective and competitive functions of the AAR and UPR pathways in stress-induced angiogenesis”的研究论文,系统地解析了AAR和UPR信号通路在应激性血管生成中的选择性和竞争性功能。在这一工作中,作者建立了苏氨酰-tRNA合成酶(threonyl-tRNA synthetase, Tars)缺失的斑马鱼模型,该模型具有异常的血管生成表型,且依赖于Tars酶活性。Tars属于氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase, aaRS)家族,该家族成员负责催化氨基酸与相应tRNA的结合,从而控制蛋白翻译的第一步。鉴于aaRS缺失可能导致氨基酸不能被充分利用以及tRNA的积累等问题,作者推测上述血管表型可能与AAR有关。然而,领域内的主流观点是这类表型是由UPR或aaRS的非经典功能导致的。
为了解析AAR和UPR的关系,作者设计了系统整合比较转录组学分析、机制研究和表型验证的研究策略。研究发现,Tars缺失导致未氨酰化的tRNAThr积累,进而选择性地激活Gcn2介导的AAR,这对于斑马鱼的血管表型是必需的;而Perk介导的UPR虽然在这一应激条件下未被激活,但它在斑马鱼正常发育时反而处于激活状态,而当AAR激活时,由于Gcn2与Perk竞争磷酸化eIF2α,使得Perk功能被减弱。这些差异可以从AAR和UPR相关基因的表达谱上明确反映出来,提示由不同激酶所催化的磷酸化eIF2α能够被生物体区分,从而辨别这些密切偶联的应激信号通路。
AAR和UPR之间的这种选择性和竞争性调控机制,反映了多种应激信号通路的协同进化,使得生物体能够经济、高效、特异地识别和应对多种不同类型的刺激。另外,由于这些应激信号通路与多种人类疾病密切相关,这项研究建立的技术策略有潜力直接应用于临床样本的检测,从而快速准确地鉴别疾病组织中哪些应激信号通路处于激活状态,使临床上根据ISR分支激活状态,从而对ISR异常导致的疾病进行分子分型成为可能,有助于针对性地选择治疗策略。
图3 研究工作的概括以及AAR和UPR选择性和竞争性功能的模式图。左边方框显示,基于以前的研究,氨基酰-tRNA合成酶的缺失导致血管发生缺陷表型的原因一般被认为是激活UPR信号通路,而AAR是否参与其中,以及AAR与UPR之间是否存在协同关系,均有待于研究。中间方框显示本项研究的技术方案,即系统地整合比较转录组学分析,基于遗传学和药物处理的机制研究,以及表型的分析和验证。右边方框显示本项研究建立的结论,即tars缺失选择性激活Gcn2介导的AAR,这对于血管表型是必需的。虽然Perk介导的UPR在这一应激条件下未被激活,但研究发现其在正常发育时反而处于激活状态,而当AAR激活时,Gcn2与Perk竞争磷酸化eIF2a使得Perk功能被减弱。由Gcn2和Perk催化的磷酸化eIF2a(p-eIF2a)具备不同功能,导致下游AAR和UPR靶基因的差异。问号指代正常发育过程中UPR的诱导因素、调控机制和功能尚不清楚,但应与本文阐明的AAR明显不同。
据悉,这项研究工作曾在美国血液学会(ASH)年会上被评为“Best of ASH”。这一工作还得到了上海交通大学医学院附属瑞金医院陈竺院士、中科院分子细胞卓越中心(生化与细胞所)王恩多院士、瑞金医院赵维莅副院长、浙江大学徐鹏飞研究员、中科院营养与健康研究院王兰研究员、哈佛大学医学院周一研究员等的大力支持。瑞金医院博士生张凡、中科院生化与细胞所博士生曾奇玉、上海市第一人民医院心脏科徐浩副主任医师、瑞金医院博士生许艾宁为本文共同第一作者,孙晓建、周小龙、陈赛娟为共同通讯作者。该研究涉及的斑马鱼品系,已保藏至国家水生生物种质资源库国家斑马鱼资源中心。