| ZKO number |
ZKO415 |
| Recent progress of this line |
F2 generation has been raised
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Gene name |
adamtsl7
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Ensembl ID |
ENSDARG00000055439
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Zebrafish strain |
AB
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Cas9 target site 1 sequence |
sense strand
TGGGACAGCGACTCCAGCAGcgg;GGTTTCCAGGTGGATGTGTGcgg
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Cas9 target site 2 sequence |
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Position in the gene |
exon1,exon2
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Restriction enzyme (RE) |
n/a
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PCR primer (forward) |
CTCTATTCAGAGACAGCTCTACTGCA
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PCR primer (reverse) |
CCCAAATAGTTCCTGGTCTTGTG
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Length of expected PCR product (bp)
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5539
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Length of expected RE digestion product (bp) |
n/a
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Plasmids used for making Cas9 mRNA |
pXT7-hCAS9
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| Plasmids?used?for?making?gRNA |
pMD19T-gRNA
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| Primers?used?for?making?gRNA |
Pr-ZKO 415
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Dosage of injected Cas9 mRNA (ng/ul)
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300
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Dosage of injected gRNA (ng/ul)
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20
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Survival rate of F0 embryo @ 1dpf (%)
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88
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Method to estimate mutation efficiency |
sequencing of PCR product
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Stage of the embryos collected for mutation detection |
http://www.zfish.cn/upload/file/ZKOPDF/ZKO415.pdf
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Mutation efficiency in F0 embryos (%)
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30
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Picture?from?F0?embryos
? (gel?picture?or?sequencing?picture) |
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Mutation type
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deletion
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Germline transmission efficiency in adult F0
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15%
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Wild-type (WT) sequence
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CTCTATTCAGAGACAGCTCTACTGCAGTGTTTCTCACTGACACACACACACACACATATCATATTAACTGCTTTATTCTGCTCATGGCTTGTGATAGCGGACACCGGTGGAGACTCATCCTGCATTTCCTCCAGATGACCCTCCTGCTCTTCTTCCTCTGCCCACCCACAGAGCCTGCTCCCTGGGACAGCGACTCCAGCAGCGGCCCTGGAGAGGTAAGAAGCGCAGACAAATGACAAATGATACCAGTGGCAGGACTACACAGAACGCATGCAAATGTCTGTACAGGCAAACCCCAGTTACCCAGAACAATGTTTCATAGTATGTTGGAGAATATCATTATGAATTAATGTGGTATACTTTTAAAACTAATATTATTTTTTTTATAGTTTATAATTTATATATGTTTAATTTAGTATTATGTTCATATAAAGTTAATTTATTTCTGTTTTGTTCAGCTCATAAAGATTCTTTTCACTATCAAAGTATATACAGTACTGAATATATGGTCACACTTCACAATAAGGTTTCATTAAAGTATTTACTAACATGAACTAATTATGAACAACACTAATAGAACATTTATTAATCATAGTTAACAAATTATTAATCATGAGTTGACATGAACTAACAATGAGCAACGGTATTTTATTATCTAATGTTAATTGACATGAACAAATAATGGAATTATTGTTCATCGTTTATTGATGTTAAATACATGAACTAATATTAACTAATACAACCTTATTGTAAAGTGTTACCATATAAGATCCTTAAAATGTTGAAATATGAATATGTGACTTTTACTTACTTTACTTGGCTTTTACCTAAAATGTTAGTAATGCACCGACATAATGCAACACTTTAATGTCAATTCGCAATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTAATTTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTTAATTAATTTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATTTTGTATCATATTTACTGTGCAGTTTACTGTGTAGTTACACTAAAAAACATATATTTTGAGTTATTGAACTATTAAACTATTATTGGAATATGATTCAAAGTGTTTTTATTATTCATTCATTCATTTGTTTATTTCATTCATTCATTTTCTTTTCAGCTTAGTCCCTTTATTAATCTGGGGTCGCCACAATGGAATGAACCACCAATTCATCCATATGTTTTACGCAGCAGATGCCCTTCCAGCTGTAACCCATCTCTGGGAAACATCCATACACTCTCATTCACACTCATACACTACGGACAATTTAGCCTACCTAATTCACCTGTACCCCAAGTCTTTGAACTGTGAGGAAAACCGGAGCACCCGTAGGAAACCCACACGAATGCGGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAACCCCAACTGACCCAGCCAAGGCTCGAACCGGCAGCGACCTTCTTGCTGTGAGGCGACATCATAACCTACTGCTTCACTGCGTTGCTTTGTTATTCAATATGTGTTCATTATTTACTAGTAATTTTATTAGTGAAATCTGTTTCTACATCAAATTCTTAGTGTACATTAAGAATTGATACAAATAGTTACCATAACCATATACATTTCCTGATGTTTTATATAAAATATATATTAAAATTACGTTGAAATCTACATATATGTGCTGTATAAACATACAAAATTGTAAATATATATTTTCTGTAAAATGAAAATATGAATTAAATCTGTAGTCTTAACTCCATATAAAGTGAAGTATTGTAGTGCAGTTTCACAAAAAGCAAGCATGTAAAACAATAGAACAATATATAGAAAAGAATATCAGAAAATATTATTATTGTTATTATAAATTCTTACATATCGAGTCATCATTGTGAGTGTTATGTGAGTAGCGTTATTACTCATATACAACTGAGTCTAGTTAACACTAAAGGAGGCATCGATGGCCCTTGAAAAGACCAACTGGAGGATAAAGCATTGCAAAACTGCAGAGTCTGGATTATTGGGGGCGCTGGGGTCAACTTTTGCCTACAATGTGGGGACCAAAAACATCCCTACAGGAGCCGTAAAACCCAAAATCACCTAGAATTGTGGGGATCAGCCAAAGGTCTCCACCAGAAAAAAATGCCTTAATAAACATACTAAATAATGTATTGATAACACTGTAAAAAAATTCCAAAAGGTTTATGAGAGGGTTGGGATAGAAAACACCATGAACTCAAAATAAAAACAAAGAAGTCACTGGAAAGTCCCCAGCATGATAGAAAAACATACCTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGCGTGTGTGCGTGTGCGTGCTGTTGAGCATGAGGACACAAAATGGTAAAATAACATAAGCGTGATGTAAATACTATCATGTTTTTATAATGTAAAAACATTCTAATTCTGAATTCTAATAATGAAAATGTCACAATAATTTGTGTTTTTTGAAATTCAAATACCATTAAGAGGTTTTCGACGACACGGTGGCTCAGTGGTTAGCACAGTTACCTCACAGCAAGAAGGTCGCTGGTTCGAGTCCCAACTGGGTCAGTTGACATTTCTGTGTGAAGTTTGCATGTTCTTCCCGTGTTCGCGTGGGTTTCCTCTGGGTGCTCCTGTTCCCCCCACAGTCCAAAGACATGTGGCACATGTGAACTGAATAAACTAAATTGGCCGTAGTGTATGTGTGTACAGTAGATAAGTGGGTATGGATGTGTCTCAGCACTGAGTTGCAGCTGGAAGGGCATCCGCTGTGTAAAACATATGCTGGATAAGTTGGTGGTTCATTCCGCTGTGGTGACCCCTGATGAACAAAGAGACTAAGCCAAAGGAAAATGAAATGAATGAATCACGAGGTTTTCAGGTCTGTTAAGGGTTAGGGTTTGATTTTAATGGAACAGGGCTACAGTTTTGTACAAAATATACACAATATAAATGTGTGTGTGTGGTTGGTGGAAGAAATTTTTTTTCCAGCCAGGATTTTGTTATATCAAGTCTTTCTTATTGTAAGTTTGACAAATTAAGATGATGAGTGTTTGTGGGCACCAAATGCTCCCATAAATATAGTAAAATCAGTTTTTTTTTTCTACCTCGTGAGGAATTTATTTTCTTCCATAAGGAAAATGTCTAATAAATCATATGGAACGAGGTATTCTGCTAGTGAAAACTGCTGTTCTTGTAGACTTCTTTAAAGCTAACAATAGAGACAGTTGTTTGTGCATTGAAACATGATTTTGATGGCTTTTAGTGTACGTTTGAATCGTGTAACAATATGGCCGCTGTCTGTCTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTTTGAATGAAAATGTTTTAAGGAAACGGCTTAAAATGAATTATTTTAGAAACAGTAAATCTTAAAAACAAACAGTCTCATCCCTCAGTAATCAGTGTTATTTTTAGTCTTGATCCTTATTCAAAAAGCAGTTGGAGTGAATTGTATCATTGCTATTTACTTGTTCATGTACTGATTCATGCTGATTCATTTAAAAATGTAAGTGAAAATGAATCAGCACATGTACGCTTGTGTGATTGCAATCTGGTTTACATATAAATTCTACTGGATTGAACGCATTTTAAAATACAGACATACACACAACTCGGTGTGATTCAAAATGTGGCTGTGTTTTGAGGAAAAAGACATCAGTAGCCTATTGAAGAGCTACATTTGTTTACTCTTTTTGATGAACTCTTGCCAGATAAGACAGGCAGTGCTGATTAATTTTCTGAAATCGGATCATCTTAGCTGTTCAATTTTGATTTTAATCTTTTTATTAATAAGATCTCAGGCAAACACTTCTGCTCAGAGGGTCTCCCATCTGAAGTGGTGAAATCTGTGTCTTCATCTGTGTGCTACAAGAACCTGAATGTGCTCTGCTGTGTGTGTGTATGTGTGATTGTGTATTGGTTAATGTGGTGTATGAGGACACAACATTGCCCAATAGGTATGACCTGGTTATATTCTATTAGTGTGGTTTATGATGACACAACATTGTCCAATAGGTTTGATCTTGTTAAACTCTATTAATGTGGTTTATGAGGACATAACATTGTCCAATAAGTATGGCCTTTTTGTATTCTATTAATGTGGTTTACGAGGACATAACATTGTCCAATAAGTATGGCTTTTTTGTATTCTATTAATGTGGTTTACTAGGAAACAACATTGTTCAATAGGGATGACCTAGTTGTATTCTATTAATGTTGTTTATGAGGAAACAACATTGTCAAATAGGTATAACCTTGTTGTATTCTATTAATGTGGTTTATGAGAACACAACATTGTCGAATAGGTATGACTTTGTATTTTATTAATGTGGTTTACAAGGACACAAGATTGTACAATAGGTTTGACCTAGTTGAACTCTATTAATGTGGTTTACGAGGAAACGAGATTGTCCAATAAGTATGACCTTGTTAAACTTTATTAATGTGGTTTATGAGGACATAACATTGTCCAATAGATATGACGTAGTTTAAATCTATTATTGTGGTTTATGAGGACATAACATTGTCTAATTGGTATGACCTAGTTTAACTCTATTGATGTGGTTTACGAGGACACAACTTTGTTCACTAGGTTTGACCTAGTTGAACTCTATTAATGTGGTTTATGAGGGCACAACTTTGTCCAATAGGTATGACCTTGTTGTATTCTATACATTTGGTTTACGAGGACACAACATTGTCCAATAGGTTTGACCTAGTTGAACTCTATTAATGTGGTTTTTGAGGACACAACATTGTCCAATAGGTATGACCTTGTTGTATACTATTAATGTGGTTTACAAGGACATGTCTTGTGTTTTAATTATTCAAAATGGTTAGAAATCATAATTTATTGGTTCTTTGACATTCAAAATGTGGTCCTTGTATTCATCCTATTTTGGTGACCAGATACCATACCTTATTAGTACTTTTTTTTTCCCCACGAGGAGAACGGCTCAAAAGTCACAAAGAATTAAGTATTTTGACAATGTAAAATGGCAGAATGGTTTATCTGAGTGTTGGGTTTATATGGTTGGAGTAAGGGAACACAATATATAGTCTGTACAGTAAAACAATTACTGTTTGTCTCTAAAGATTCCCTATAAAACATGAATGCTCAAAATGTGTGTCTGTGTGTTTGTGTGTTTGTATGTGTATCTGCAGGGCTGTGAGGGTTTCCAGGTGGATGTGTGTGGTGTGTGTGCTGGAGACGGGAGCTCGTGTGAACTGTTCAATGGGACAATCTTTCTCTCTGTGCTCTCGGTTAGATACCACAAGATCCTGGATATCCCCTCTGGAGCTCTGCGAATAAAAATACAGGAAACACACAAGACCAGGAACTATTTGGG
|
Germline mutations in selected F0
(By screening F1 embryos) |
F0-1 |
|
|
F0-2
|
|
Mosaicism in selected F0
(By screening F1 adults) |
F0-1
|
TGGGACAGCGACTC-----TGTGGTGTGTGTGC
|
|
F0-2
|
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Allele name and predicted product
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415a
415b |
TGGGACAGCGACTC-----TGTGGTGTGTGTGC (5185bp deletion)
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突变创建时间 |
2016-08-06
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填表时间 |
2013/12/16
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修改时间 |
2017/3/21
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PI/负责人 (工作单位) |
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